אנתרופיק אומרת שדגמי קלוד שלה יכולים כעת לעצב קלסרי חלבון מאפס וגם - או טוב יותר - ממומחים אנושיים מובילים, תוצאה שהחברה אימתה במעבדות רטובות ופרסמה בפוסט מחקר ביום שני שמסמן את אחת ההדגמות הברורות ביותר עד כה של AI המאיץ גילוי מדעי אמיתי.
הממצאים מגיעים משני ניסויים. בראשון, אנתרופיק בדק את יכולתו של קלוד לעצב קושרי חלבונים - חלבונים קטנים שהונדסו להיצמד בחוזקה לחלבוני המטרה - משימה שלוקחת באופן היסטורי למומחה אנושי שבועות או חודשים לכל מטרה, ואשר יושבת בלב תכנון תרופות מודרניות. For more context on this story, see our ongoing AI news.
מנצח את המדדים
בעבודה עם המעריכים החיצוניים Adaptyv Bio ו-Twist Bioscience, שייצרו ובדקו באופן עצמאי את העיצובים של קלוד במעבדה, Anthropic ניהלה קמפיין עיצוב רב-זרועות נגד 15 יעדי חלבון. קלוד הצליח מול 14 מהם, ויצר 354 קלסרים מאושרים מ-1,320 עיצובים. זה לבדו מייצג תוספת משמעותית לקורפוס הציבורי של עיצובי חלבון דה נובו: שני האוספים הקיימים הגדולים ביותר, ציין אנתרופיק, מכילים יחד בערך 770 קלסרים מתוך 5,700 עיצובים מול 40 מטרות.
שיעורי הפגיעה הם מה שמשך את תשומת הלב של הביולוגים. מודל Mythos Preview של Anthropic השיג שיעור פגיעה כולל של 26.7% כאשר תכנן מול כל המטרות בו זמנית בהפעלה של 48 שעות, כאשר קלוד אופוס 4.8 קרוב מאחור עם 22.6%. שיעורי הפגיעה האופייניים בקמפיינים לעיצוב חלבונים נעים כיום ב-10 עד 15%, ציינה החברה. כאשר Mythos Preview התמקדה ביעד אחד בכל פעם במספר הפעלות של 24 שעות, שיעור הפגיעה שלה טיפס ל-35.1%. הקמפיין שאב את היעדים שלו ממדדים שנלמדים בהרחבה - כולל כל חבילת BenchBB של Adaptyv Bio - בתוספת שני יעדים חדשים, 15-PGDH ו-GDF-8, שנבחרו במיוחד כדי להבטיח שקלוד לא יוכל להישען על הצלחות מתועדות מראש מנתוני האימונים שלו. עבור כל אחת מ-15 היעדים, החוקרים ביקשו מקלוד לעצב 30 קושרי חלבון.
על יעדי תחרות בודדים, המרווחים היו רחבים יותר. מול RBX1, חלבון המעורב בפירוק חלבון ממוקד, Mythos Preview במצב יעד יחיד השיגה שיעור פגיעה של 40% - בהשוואה ל-3.7% בקרב משתתפים אנושיים באותה תחרות - והעיצוב שלו בדירוג העליון עלה על העיצוב האנושי המנצח על זיקה מחייבת.
היו כשלים מאלפים. חלבון בטא-חבית בעיצוב דה נובו בשם BBF-14 וחלבון מחייב מלטוזה (MBP) נשארו מחוץ להישג ידם, מטרות שהחידוש והמשטחים החלקים והגמישים שלהם משאירים מעט קלסר לאחוז בו. ובהפתעה, זה היה אופוס 4.8 - לא ה-Mythos Preview החזק יותר - שהצליח ב-TNFα, יעד קשה הידוע לשמצה שהחסימה שלו עומדת בבסיס כמה מהתרופות הנמכרות ביותר שנעשו אי פעם, כולל Humira.
חוקר אוטונומי
אולי הכי בולט הוא כמה מעט מעורבות אנושית דרשה הקמפיין. לאחר הנחיה ראשונית, אנתרופיק אומר שהיא לא סיפקה הנחיות מדעיות, טכניות או תפעוליות נוספות. קלוד בחר היכן בכל חלבון לעצב מולו, יצר מבנים ורצפים מועמדים על ידי תזמור מודלים של עיצוב חלבון מומחה וקיפול משותף, והריץ את הקמפיין מקצה לקצה - עבודה שיכולה לקחת למפעיל אנושי שבועות.
המאמץ צרך עד 12,500 שעות NVIDIA H100 של חישוב עבור ריצה מרובת מטרות, ועד 2,500 שעות H100 לכל יעד במצב יעד יחיד. קלוד אפילו ייצר 15 קלסרים מאושרים המכילים מבנה משמעותי של גיליונות בטא, קיפול שקשה יותר לעצב מאשר חבילות האלפא-הליקס שרוב הכלים החישוביים כברירת מחדל.
מעיצוב מולקולות ועד קריאת נתונים גולמיים
הניסוי השני בדק צוואר בקבוק אחר, ארצי יותר: כימיה אנליטית. בכל פעם שכימאי מייצר מולקולה, עליהם לאשר מה היא ועד כמה היא טהורה, באמצעות ספקטרוסקופיה של תהודה מגנטית גרעינית (NMR) וכרומטוגרפיה נוזלית-ספקטרומטריית מסה (LC-MS). פירוש הקבצים הללו הוא עבודה ידנית קפדנית.
מסופק רק עם קבצי מכשירים גולמיים של מעבדת חוזים והנחיה קצרה בשפה פשוטה - ללא תוכנת ספק, ללא מפעיל - קלוד אופוס 5 החזיר תוצאות NMR ו-LC-MS מעובדות במלואן תוך 23 ו-19 דקות בהתאמה, תוך עבודה במקביל. התוצאות שלה תאמו את הניתוח של המעבדה עצמה. לאורך הדרך, הדגם הנדס לאחור פורמט קובץ ספק לא מתועד, אימת את הקריאה שלו מול הסכומים הרשומים של המכשיר עבור כל 2,664 הסריקות, והציע את ניסוי ההמשך המדויק - בדיקת מים כבדים - שמעבדת החוזה הפעילה באופן עצמאי שלושה ימים לאחר מכן.
אנתרופיק אומר שהריצה הדגימה גם שיקול דעת מדעי אמיתי, לא רק אוטומציה, ומציינת כי כימאי זקוק בדרך כלל לחצי שעה עד שעה לכל דגימה עבור סוג זה של ניתוח.
בטיחות ראשונה
החברה הייתה מפורשת לגבי ההשלכות לשימוש כפול. אותן יכולות מחקר אוטונומיות שיכולות לזרז טיפולים בבני אדם יכולות, ללא אמצעי הגנה חזקים, לאפשר מחקר מסוכן כמו פיתוח נשק ביולוגי, הזהיר אנתרופיק. משימות מחקר מדעי החיים חסומות כיום במודל המסוגל ביותר שלה, והחברה אומרת שהיא מכינה תוכנית גישה מהימנה למדענים - אחת מהעדיפויות הגבוהות ביותר שלה. בינתיים, קלוד אופוס 5 נשאר הדגם הזמין ביותר שלו.
אנתרופיק שיתפה את ההנחיות ששימשו לקמפיינים יחד עם כל הנתונים במבחנה ובסיליקו שנוצרו - אמצעי שקיפות שיאפשר למעבדות חיצוניות לאמת את הטענות. עבור תחום שעדיין ממיין הייפ מתוצאות, הפוסט מציע משהו נדיר: ראיות מאומתות במעבדה לכך שמודל AI למטרות כלליות יכול לעשות, בשעות, עבודה שפעם הגדירה את הקריירה של מומחה.
---
Stay Ahead of AIGet the latest AI news, analysis, and breakthroughs — all in one place.
Read more AI news →
