スタンフォード大学の Evo ゲノムモデルの背後にあるチームによって設立された新興企業である Radical Numerics は、2026 年 10 月 20 日に、新しい Omnii-1 AI モデルによって設計されたバクテリオファージが人間の患者に投与されたと発表しました。これは、AI によって生成されたウイルスの世界初の臨床使用です。この主張を最初に報じたのはニューヨーク・タイムズで、同社は同日、詳細な技術レポートをウェブサイトで公開した。 最新の AI 開発 をフォローしている読者にとって、これは AI によって設計された生物学が実験台から患者の血流に移行した瞬間を示しています。

ファージは、満足のいく代替手段が存在しない場合に、重篤な症状の患者が臨床試験以外で治験治療を受けることを可能にする調節経路であるコンパッショネイトユース（思いやりのある使用）のもとで投与された。同社は、この治療は抗生物質耐性細菌感染症を対象としたものだとしているが、機密保持とプライバシーの要件を理由に患者の状態、場所、転帰などの開示は拒否している。

ゲノム言語モデルから生きたウイルスまで

Omnii-1 はマルチモーダルなゲノム言語モデルです。これは、膨大な量の DNA 配列とマルチオミクス データでトレーニングされ、特にファージ ゲノムで微調整された AI システムです。ファージ、正式にはバクテリオファージは、人間の細胞に触れずに細菌に感染して殺すウイルスであり、そのため、抗生物質ではもはや除去できない感染症を治療するための数十年前の候補となっています。

Radical Numerics チームは、メンバーが会社設立前に Evo および Evo 2 ゲノム モデルを作成しており、Omnii-1 を使用して 3 つのことを実行しました。実行可能なファージ変異体の生成、最も有望なデザインの優先順位付け、およびどのファージがどの細菌株に感染するかを予測することです。このモデルでは、ゲノムをゼロから設計するのではなく、ウイルスの複製に必要な機構を維持しながら、ファージが認識できる細菌を決定する受容体結合尾繊維遺伝子などの特定の領域を設計します。

テクニカルレポートが示すもの

同社のレポートには、デザインキャンペーンからの具体的なベンチマークが含まれています。よく特徴付けられた大腸菌ファージ T7 を使ったある実験では、11 ～ 15 個のアミノ酸変化を含む Omnii-1 設計の変異体の 69.9 パーセントが生存可能なファージとして正常に回収されましたが、ランダム コントロールではわずか 4.8 パーセントでした。測定可能な活性を持つ6,694個の変異体のうち、2,161個は野生型ファージの活性を上回っていた。これには最大28個のアミノ酸変化を含む設計が含まれているが、野生型を超えるランダム対照は5個を超えていない。

このモデルは、株固有の優先順位付けにも有効であることが証明されました。 2 つの細菌株では、Omnii-1 の上位 100 位にランク付けされた候補のうち 97 株と 96 株が活性閾値をクリアしました。ライブラリ全体の 4.5 パーセントのみがアクティブだったよりハードな 3 番目の系統では、モデルの上位 100 ピックの 24 パーセントが基準をクリアしました。これは基本レートの 5 倍以上です。 37 の大腸菌株の保持されたクレードでは、わずか 2 つのファージからの予測が対象株の 91.4 パーセントをカバーし、このモデルは、大腸菌データからの学習を、創傷、火傷、および嚢胞性線維症感染の背後にある危険な病原体である緑膿菌に転移する際に、GenoPHI のような特殊なファージ宿主予測ワークフローを上回りました。

ファージ療法が今重要な理由

この臨床的マイルストーンは、抗生物質耐性危機が悪化する中で達成された。 Radical Numerics の報告書に引用されている数字によると、抗生物質耐性は 2021 年に世界で推定 470 万人の死亡に関連しており、耐性に起因する死亡者数は 2025 年から 2050 年までに合計 4,000 万人近くになると予測されています。

ファージ療法は、その危機を回避する方法を提供します。ファージは、広域抗生物質では対応できない特異性で特定の細菌株を標的にし、その過程で有益な腸内細菌を温存できるからです。ボトルネックは常に一致です。今日の個別化ファージ療法は、各患者の感染に対して天然ファージコレクションを苦労してスクリーニングすることに依存しており、選択肢のない患者にとって遅延は生命を脅かす可能性があります。ボトルネックとなる直接的な攻撃をオンデマンドでファージを設計およびランク付けできる AI システム。この開発は、医学をはるかに超えた AI 研究報道 と明らかに関連しています。

大きな主張、詳細はほとんどない

重要な注意事項があります。見出しの結果は企業の主張だ。ニューヨーク・タイムズ紙は同社を患者の治療を「主張」している新興企業であるかのように仕立て上げ、同社の技術報告書は査読を受けていない。 Radical Numerics は患者や関与した医師に関する情報の提供を拒否し、臨床転帰も開示できないため、この治療法が実際に効果があるかどうかを社外の誰も検証することはまだできません。以前の注目を集めたファージ症例、つまり緊急プログラムによる個々の患者に対する治療には、さまざまな再発歴があります。

それでも、このマイルストーンはある検証可能な意味では現実である。AIで生成されたファージは、政府の監督下での思いやりのある利用プログラムの下で人間への投与に必要な規制と安全基準を通過したのだ。またタイムズ紙は、Radical Numerics ががんワクチンの設計やウイルスがパンデミックを引き起こすかどうかの評価など、他の分野にも Omnii-1 を適用していると報じている。これは、同じ設計能力が両方向に作用し、AI とバイオセキュリティ の報道が今後も緊張状態にあることを思い出させるものである。

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