Radical Numerics의 Omnii-1 AI, 최초로 인간 환자 치료에 사용되는 파지 설계

Evo 팀이 설립한 스타트업은 AI 생성 바이러스로는 처음으로 AI가 설계한 박테리오파지가 동정적 사용 하에 환자에게 제공되었다고 밝혔습니다.

스탠포드의 Evo 게놈 모델 팀이 설립한 스타트업인 Radical Numerics는 2026년 10월 20일에 새로운 Omnii-1 AI 모델로 설계한 박테리오파지가 인간 환자에게 투여되었다고 발표했습니다. 이는 AI 생성 바이러스의 세계 최초의 임상 사용입니다. 뉴욕타임스는 이 주장을 처음 보도했고, 회사는 같은 날 자사 웹사이트에 자세한 기술 보고서를 게재했다. 최신 AI 개발을 따르는 독자들에게는 AI가 설계한 생물학이 실험실 벤치에서 환자의 혈류로 옮겨진 순간을 의미합니다.

파지는 심각한 상태의 환자가 만족스러운 대안이 없을 때 임상 시험 이외의 조사 요법을 받을 수 있도록 허용하는 조절 경로인 동정적 사용에 따라 제공되었습니다. 회사는 이 치료법이 항생제 내성 세균 감염을 표적으로 삼았다고 밝혔지만 기밀 유지 및 개인 정보 보호 요구 사항을 이유로 환자의 상태, 위치 또는 결과 공개를 거부했습니다.

게놈 언어 모델에서 살아있는 바이러스까지

Omnii-1은 다중 모드 게놈 언어 모델입니다. 즉, 방대한 양의 DNA 서열과 멀티오믹스 데이터에 대해 훈련을 받은 다음 파지 게놈에 대해 구체적으로 미세 조정되는 AI 시스템입니다. 공식적으로 박테리오파지인 파지는 인간 세포에 닿지 않고 박테리아를 감염시키고 죽이는 바이러스로, 항생제로는 더 이상 제거할 수 없는 감염을 치료하기 위한 수십 년 된 후보가 되었습니다.

회사를 설립하기 전에 Evo 및 Evo 2 게놈 모델을 만든 구성원으로 구성된 Radical Numerics 팀은 Omnii-1을 사용하여 실행 가능한 파지 변종 생성, 가장 유망한 디자인의 우선 순위 지정, 어떤 파지가 어떤 박테리아 균주에 성공적으로 감염될지 예측하는 세 가지 작업을 수행했습니다. 처음부터 게놈을 설계하는 대신 모델은 바이러스가 복제하는 데 필요한 기계를 보존하면서 파지가 인식할 수 있는 박테리아를 결정하는 수용체 결합 꼬리 섬유 유전자와 같은 특정 영역을 설계합니다.

기술 보고서의 내용

회사의 보고서에는 디자인 캠페인의 구체적인 벤치마크가 포함되어 있습니다. 잘 알려진 E. coli 파지 T7에 대한 한 실험에서, 11~15개의 아미노산 변화를 포함하는 Omnii-1 설계 변종의 69.9%가 생존 가능한 파지로 성공적으로 회수된 반면, 무작위 대조군의 경우 단 4.8%만이 성공적으로 회수되었습니다. 측정 가능한 활성을 갖는 6,694개의 변종 중 2,161개가 야생형 파지의 활성을 초과했습니다. 여기에는 최대 28개의 아미노산 변화가 포함된 설계가 포함되었으며, 야생형을 초과하는 무작위 대조군에는 5개 이상이 포함되지 않았습니다.

이 모델은 또한 변형별 우선순위 지정에도 효과적인 것으로 입증되었습니다. 두 가지 박테리아 균주의 경우 Omnii-1의 상위 100개 후보 중 97개와 96개가 활동 임계값을 통과했습니다. 전체 라이브러리의 4.5%만이 활성화된 더 어려운 세 번째 변형에서는 모델의 상위 100개 선택 중 24%가 기준을 통과했습니다. 이는 기본 속도의 5배 이상입니다. 37개 E. coli 계통의 보류된 계통에서 단 두 개의 파지로부터의 예측은 적합한 계통의 91.4%를 다루었으며, 모델은 E. coli 데이터에서 상처, 화상 및 낭포성 섬유증 감염의 배후에 있는 위험한 병원체인 Pseudomonas aeruginosa로 학습을 전송할 때 GenoPHI와 같은 특수 파지-숙주 예측 워크플로우를 능가했습니다.

파지 치료가 지금 중요한 이유

항생제 내성 위기가 악화되는 가운데 임상 이정표가 달성되었습니다. Radical Numerics의 보고서에 인용된 수치에 따르면, 항생제 내성으로 인해 2021년 전 세계적으로 약 470만 명이 사망했으며, 내성으로 인한 사망자는 2025년부터 2050년까지 총 4천만 명에 이를 것으로 예상됩니다.

파지 치료는 파지가 특정 박테리아 균주를 표적으로 삼아 특정 박테리아 종을 표적으로 삼을 수 있고 그 과정에서 유익한 장내 박테리아를 아끼는 광범위한 항생제와 일치할 수 없기 때문에 이러한 위기를 피할 수 있는 방법을 제공합니다. 병목 현상은 항상 일치했습니다. 오늘날의 맞춤형 파지 치료법은 각 환자의 감염에 대해 천연 파지 수집을 힘들게 검사하는 데 달려 있으며, 지연은 선택의 여지가 없는 환자에게 생명을 위협할 수 있습니다. 직접적으로 병목 현상을 일으키는 주문형 파지 공격을 설계하고 순위를 매길 수 있는 AI 시스템은 의학을 훨씬 넘어서는 AI 연구 범위와 명백한 관련성을 지닌 개발입니다.

큰 주장, 적은 세부사항

중요한 주의 사항이 있습니다. 헤드라인 결과는 회사의 주장입니다. New York Times는 이 회사를 환자를 치료하기 위해 "주장"하는 스타트업으로 구성했으며 회사의 기술 보고서는 동료 검토를 거치지 않았습니다. Radical Numerics는 환자 또는 관련 의사에 대한 정보 제공을 거부했으며 임상 결과를 공개할 수 없기 때문에 회사 외부에서는 아직 치료법이 실제로 도움이 되었는지 확인할 수 없습니다. 응급 프로그램에 따라 개별 환자를 치료하는 초기의 세간의 이목을 끄는 파지 사례에는 복제 이력이 혼합되어 있습니다.

그럼에도 불구하고 이 이정표는 검증 가능한 한 가지 의미에서 현실적입니다. AI가 생성한 파지는 정부가 감독하는 자비로운 사용 프로그램에 따라 인간에게 투여하는 데 필요한 규제 및 안전 기준을 통과했습니다. The Times는 또한 Radical Numerics가 암 백신 설계 및 바이러스가 전염병을 유발할 수 있는지 여부를 평가하는 등 다른 분야에 Omnii-1을 적용하고 있다고 보도합니다. 이는 동일한 설계 기능이 양방향으로 감소하고 긴장감 AI 및 생물보안 보도가 계속 추적될 것임을 상기시켜줍니다.